一塩基多型　SNP

2022/07/27

一塩基多型（いちえんきたけい）

Single Nucleotide Polymorphism；SNP　スニップ

SNPとは

DNAの主要な核酸塩基には、アデニン（A)、シトシン（C)、グアニン（G)、チミン（T)があります。

SNPとは、DNAの中の１つの核酸塩基が別の核酸塩基に置き換わったものです。

ヒトDNAではこのSNPは数百万個あるとされるため、「一塩基多型」と呼ばれています。

このSNPによって、体質の違いや、病気のかかりやすさ、薬の効き方などに違いが出るとされています。

SNPで例えば何がわかるの？

１PN由来ヒト胚盤胞の救出

１PN胚の18.4％が胚盤胞まで到達しました。１PN由来胚盤胞の77.6％が正常胚、20％が正常男性型であり、生殖的に有用である可能性が示唆されました。

１PN由来胚盤胞の75％は二親性であり、その半数は正常胚であったことから、40％が生殖的に有用である可能性が示唆されました。

２つの栄養外胚葉の一致率は93.3％、染色体一致率は73.3％でした。

栄養外胚葉と内細胞塊間の一致率は78.8％でしたが、染色体一致率は57.6％でした。

部分的な異数性を考慮しない場合、２つの栄養外胚葉の一致率と染色体一致率はそれぞれ100%と80%に、栄養外胚葉と内細胞塊間の一致率と染色体一致率はそれぞれ84.8%と75.8%に増加しました。

0PNと1PNから発生する胚をSNPで調べると、PGT-Mの移植可能な胚が増加します。

0PN胚盤胞の75.51％と1PN胚盤胞の42.86％が両親からの正常胚であり、 1対の遺伝子によって制御される遺伝性疾患の正確な遺伝子診断が可能となりました。

合計で、PGT-M周期の31％（13/42）が胚移植に到達するか、または非罹患0PNまたは1PN胚で胚移植を繰り返すことができました。

開始周期あたりの生産率は9.52%から16.67%に増加しました。

子宮外妊娠における新倍数体解析

遺伝子検査の結果、検査した8検体すべてが正常胚（女性6、男性2）でした。

正常単一胚移植による体外受精後の奇胎妊娠

異常受精卵（１PN）に由来する正常胚を移植した結果、流産と疑われる臨床妊娠が発生しました。

この妊娠を医学的に管理した後に採取した子宮内容物を次世代シーケンサーで解析し、「46,XX　全胞状奇胎」と報告され、父親由来の対立遺伝子が1組確認されました。

SNPマイクロアレイにより、流産の3%で奇胎妊娠が検出されることが判明

父方の3倍体は638例（2.8％）、父方の完全片親性ダイソミーは72例（0.3％）に検出されました。片親性ダイソミーは、一方の親からのみ染色体を受け取り、他方からは受け取らない時に生じます。

病理組織学および／または超音波検査では、部分胞状奇胎の71％および全胞状奇胎の30％が検出されませんでした。

ARTにおける凍結胚盤胞移植の流産受精卵における染色体異常頻度の低下

35歳以上の患者では、凍結胚盤胞移植は新鮮胚盤胞移植よりも流産胎児絨毛染色体検査の染色体異常の発生率が低いことと有意に関連しました（調整オッズ比：0.171）。

35歳未満の患者において、凍結胚盤胞移植は新鮮胚盤胞移植よりも初期胚移植周期および胚盤胞移植周期の両方で染色体異常の発生率が低いことと有意に関連していました（0.545、0.357)。

生殖補助医療を受けた多嚢胞性卵巣症候群女性の流産受精卵における高い染色体異常率

多嚢胞性卵巣症候群患者の受精卵では、対照群と比較して染色体異常の頻度が高値でした（61.3％対 47.8％）。

多嚢胞性卵巣症候群は胚・胎児の染色体異常の危険因子として同定され、オッズ比はそれぞれ1.957、2.008でした。